Comparison of: (A) sequence2.fasta 110005943 Pantholops hodgsonii hemoglobin alpha chain mRNA, - 502 nt (B) sequence1.fasta 126742336 Ochotona curzoniae hemoglobin alpha chain mRNA, c - 429 nt using matrix file: DNA (5/-4), gap-open/ext: -12/-4 E(limit) 0.05 10 20 30 40 50 60 110005 ATGGTGCTGTCTGCCGCCGACAAGTCCAATGTCAAGGCCGCCTGGGGCAAGGTTGGCGGC :::::::::::: :::: :::::: :::: ::::::::::::::::::::::: :: ::: 126742 ATGGTGCTGTCTCCCGCTGACAAGGCCAACGTCAAGGCCGCCTGGGGCAAGGTCGGGGGC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 110005 AACGCTGGAGCTTATGGCGCAGAGGCTCTGGAGAGGATGTTCCTGAGCTTCCCCACCACC :::: :: : :::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::: 126742 CACGCCGGCGAGTATGGCGCCGAGGCCCTGGAGAGGATGTTCCTGAGCTTCCCCACCACC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 110005 AAGACCTACTTCCCCCACTTCGACCTGAGCCACGGCTCCGCCCAGGTCAAGGGCCACGGC :::::::::::::::::::::::: ::: ::::::::::::::::::::::: ::::::: 126742 AAGACCTACTTCCCCCACTTCGACGTGACCCACGGCTCCGCCCAGGTCAAGGCCCACGGC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 110005 GAGAAGGTGGCCGCCGCGCTGACCAAAGCGGTGGGCCACCTGGACGACCTGCCCGGTACC :::::::::::: :: :: ::: : : :: : :::: :::::::::::::::: :: 126742 AAGAAGGTGGCCGATGCCCTCACCCAGGTCGTCGACCACTTGGACGACCTGCCCGGCGCC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 110005 CTGTCTGATCTGAGTGACCTGCACGCCCACAAGCTGCGTGTGGACCCGGTCAACTTCAAG ::::: : :: :: :::::::::::::: :::::::: :::::::: :: ::::::::: 126742 CTGTCCGCGCTCAGCGACCTGCACGCCCAAAAGCTGCGGGTGGACCCTGTTAACTTCAAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 110005 CTTCTGAGCCACACCCTGCTGGTGACCCTGGCCTGCCACCTCCCCAATGATTTCACCCCC :: ::: ::: ::::::::::::::::::: ::::: ::::::::: ::::: :: 126742 CTCCTGGCTCACTGCCTGCTGGTGACCCTGGCCAACCACCACCCCAATGAATTCACTCCT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 110005 GCCGTCCACGCCTCCCTGGACAAGTTCTTGGCCAGCGTGGGCACCGTGCTGACCTCCAAA :: :: ::::::::::::::::::::: :::::: :::: :::::::::: :::::::: 126742 GCGGTGCACGCCTCCCTGGACAAGTTCCTGGCCAACGTGAGCACCGTGCTCACCTCCAAG 370 380 390 400 410 420 430 110005 TACCGTTAA :: :::::: 126742 TATCGTTAA 110 120 130 140 150 160 110005 CCTGAGCTTCCCCACCACCAAGACCTACTTCCCCCACTTCGACCTGAGCCACGGCTCCGC : ::: : : : :: :: :: : : :: : : : :: : : : : : : 126742 CGTGACCCACGGCTCCGCCCAGGTCAAGGCCCACGGCAAGAAGGTGGCCGATGCCCTCAC 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 110005 CCAGGTCAAGGGCCACGGCGAGAAGGTGGCCGCCGCGCTGACCAAAGCGGTGGGCCACCT ::::::: : :::: :: : :: ::: ::: ::: :: ::: : :: :::: 126742 CCAGGTCGTCGACCACTTGGACGACCTGCCCGGCGCCCTGTCC---GCGCTCAGCGACCT 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 110005 GGACGACC------TGCCCG-GTACCCTGTCTGATCTGAGTGACCTGCACGCCCACAAGC : ::: :: ::: : : ::::::: : : : : : :: : :: ::: : 126742 GCACGCCCAAAAGCTGCGGGTGGACCCTGT-TAACTTCA---AGCTCCTGGCTCACTGCC 270 280 290 300 310 290 300 110005 TGCGTGTGGACCCGGTCAAC ::: ::: :: :: :::: 126742 TGCTGGTGACCCTGGCCAAC 320 330 160 170 180 190 200 110005 CGGCTCCGCCCAGGTCAAGGGCCACG---GCGAGAAGGTGGCCGCCGCGCTG :: :: : : ::::: :::::::: ::::: : : :::: :: ::: 126742 CGCCTGGGGCAAGGTCGGGGGCCACGCCGGCGAGTATGGCGCCGAGGCCCTG 40 50 60 70 80 90 30 40 50 60 70 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CCTGAGCTTCCCCACCACCAAGACCTACTTCCCCCACTTCGACGTGACCCACGGCTCCGC 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 110005 CAAAGCGGTGGGCCACCTGGACGACCTGCCCGGTACCCTGTCTGATCTGAGTGACCTGCA : : : :: :::: : : :: ::: : :::: : : : :::: : 126742 CCAGGTCAAGGCCCACGGCAAGAAGGTGGCCGATGCCCTCACCCAGGTCGTCGACC---A 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 110005 CGCCCACAAGCTGCGTGTGGACCCGGTCAACTTCA---AGCTTCTGAGCCACACCCTGCT : :: : :::: : : :: : : ::: : :: : ::: : :::: 126742 CTTGGACGACCTGCCCGGCGCCCTGTCCGCGCTCAGCGACCTGCACGCCCAAAAGCTGCG 220 230 240 250 260 270 330 110005 GGTG-ACCCTG :::: :::::: 126742 GGTGGACCCTG 280 170 180 190 200 210 110005 GCCCAGGTCAAGGGCCACGGCGAGAAGGT-GGCCGCCGCGCTGACCA ::: : ::::::: : : : : ::::: :: ::: ::: : : : 126742 GCCAACGTCAAGGCCGCCTGGGGCAAGGTCGGGGGCCACGCCGGCGA 30 40 50 60 70 320 330 340 350 360 370 110005 GCCACACCCTGCTGGTGACCCTGGCCTGCCACCTCCCCAATGATTTCACCCCCGCCGTCC :: : ::: : : : ::: : : : : :: ::: :::::: : :::: 126742 GCTCCGCCCAGGTCAAGGCCCACGGCAAGAAGGTGGCCGATGCCCTCACCCAGGTCGTCG 160 170 180 190 200 210 380 390 400 410 420 430 110005 ACGCCTCCCTGGACAAGTTCTTGGCCAGCGTGGGCACCGTGCT----GACCTCCAAATAC :: :: ::::: : : :: :: ::: ::: ::: ::::: :: : 126742 ACCACT---TGGACGA---CCTGCCCGGCGCCCTGTCCGCGCTCAGCGACCTGCAC--GC 220 230 240 250 260 440 110005 CGTTAAGCTGGGG : :::::: :: 126742 CCAAAAGCTGCGG 270 370 380 390 400 110005 CCGCCGTCCACGCCTCCCTGGACAAGTTCTTGGCCAGCGTGGGC :: :::: : ::: :: :: :::: :: :: : :: ::: 126742 CCAACGTCAAGGCCGCCTGGGGCAAGGTCGGGGGCCACGCCGGC 30 40 50 60 170 180 190 200 210 110005 CTCCGCCCAGGTCAAGGGCCACGGCGAGAAGGTGGCCGCCGCGCTGACC : :: ::: :: :::: :: : : :: ::: : ::: ::: ::: 126742 CGCCTCCCTGGACAAGTTCCTGGCC---AACGTGAGCACCGTGCTCACC 370 380 390 400 410