ID   FN2_2; MATRIX.
AC   PS51092;
DT   MAR-2005 (CREATED); MAR-2005 (DATA UPDATE); DEC-2007 (INFO UPDATE).
DE   Fibronectin type-II collagen-binding domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2742712; R2=0.0110785; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=788; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=382; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,-17,-2,3,-19,-7,-13,-15,-7,-18,-14,-1,-9,-3,-12,14,6,-8,-30,-17,0;
MA   /M: SY='D'; M=-8,12,-25,15,10,-20,-11,1,-23,-3,-19,-14,8,-9,2,-7,1,-4,-21,-28,-11,5;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-29,-1,-11,-26,42,-10,-35,-12,-27,-18,1,-18,-13,-13,-1,-16,-27,-19,-17,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-1,6,-27,9,18,-28,-11,-6,-25,9,-22,-15,2,0,7,2,-1,-8,-22,-27,-18,12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-31,-10,0,-22,-15,-15,-18,-1,-19,-12,-13,35,-6,-6,-7,-7,-21,-25,-19,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-20,-18,-12,-10,-25,-4,6,-6,-3,3,-14,-21,-11,-8,-9,-6,14,-26,-5,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,74,-30,-20,3,-30,12,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,8,28,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-20,-37,-28,73,-28,-19,-1,-29,7,-1,-18,-29,-37,-19,-16,-8,-1,7,28,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-14,-21,-19,-12,-10,-25,-18,8,-7,2,4,-10,-18,-7,-8,-7,3,8,-24,-7,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-25,-26,-29,-25,47,-31,1,4,-20,5,2,-20,-29,-23,-15,-20,-10,-2,17,52,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,3,-27,2,5,-23,-9,2,-23,10,-17,-8,6,-16,10,14,-5,-10,-22,-24,-10,6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-28,-3,-12,-28,46,-13,-34,-12,-28,-19,10,-19,-12,-10,2,-15,-28,-24,-26,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,1,-26,-1,6,-21,-19,2,-22,17,-21,-9,4,-14,9,19,-3,-4,-18,-24,-7,6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-22,-9,-2,-14,-16,-13,-12,-4,-13,-9,-3,-15,-2,-5,3,4,-10,-10,-8,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-18,-29,-19,-18,24,-29,25,-2,-13,-1,1,-16,-28,-10,-10,-18,-11,-9,16,62,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-12,2,-24,2,-2,-1,-17,15,-18,-8,-15,-10,3,-18,-3,-6,0,-3,-17,-17,11,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-3,13,-21,18,10,-27,-3,-7,-26,-1,-25,-19,9,-10,1,-6,14,4,-19,-34,-19,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-29,-20,-20,-20,-40,-30,-29,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-16,-20,-17,-6,-26,-22,9,-16,1,1,-8,-14,-13,-16,6,29,10,-27,-7,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-19,-6,0,-14,-18,-4,-14,-2,-12,-8,-2,-14,-1,2,7,11,-7,-28,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-26,17,25,-28,-13,1,-27,4,-21,-17,4,-8,9,-2,3,-3,-23,-30,-15,16;
MA   /M: SY='G'; M=-5,0,-29,1,-6,-29,44,-11,-37,-12,-28,-20,6,-17,-11,-11,0,-16,-30,-24,-25,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-23,1,3,-23,-12,-3,-27,12,-25,-15,5,-15,8,29,9,1,-18,-29,-14,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-15,2,4,-9,-8,0,-15,-2,-13,-9,3,-6,1,-1,3,0,-12,-17,-7,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-17,26,6,-16,-3,-3,-19,-4,-13,-14,7,-8,-3,-7,0,-5,-15,-20,-10,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-25,-11,-15,-14,23,-13,-21,-15,-15,-12,1,-17,-16,-14,-3,-11,-17,-21,-17,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-13,-26,-15,-8,0,-21,1,-11,3,-7,-1,-10,-20,-2,6,-12,-9,-12,-1,13,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,-28,-19,-10,-8,-25,-13,-3,-10,10,3,-20,5,-10,-3,-19,-10,-8,-22,-8,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-36,-48,-35,-23,7,-20,-28,-21,-18,-20,-20,-37,-28,-17,-18,-37,-28,-30,136,26,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=27,-7,-13,-11,-6,-21,3,-16,-16,-11,-20,-15,-2,-5,-7,-16,20,6,-8,-28,-21,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-12,-16,-14,-6,-23,-21,0,-14,1,-3,-8,-15,-14,-13,9,34,8,-28,-8,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-3,1,-13,-6,-8,-12,-20,-18,-11,-8,-11,-10,1,-11,-8,-6,16,40,-2,-30,-10,-9;
MA   /M: SY='A'; M=7,-4,-20,-4,4,-18,-10,-8,-16,-7,-15,-12,-5,-3,-1,-11,7,2,-13,-24,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,28,-22,25,4,-23,-8,1,-22,-1,-25,-19,29,-16,-2,-3,7,-1,-20,-36,-16,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-28,-26,-23,40,-29,7,1,-15,3,3,-21,-29,-17,-13,-21,-11,-7,26,61,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-14,32,-27,44,19,-33,-9,-1,-32,0,-26,-22,15,-10,4,-7,3,-7,-25,-36,-19,12;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-27,-2,6,-23,-1,-6,-25,9,-21,-11,1,-14,5,10,-2,-7,-21,-22,-12,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-15,37,-23,49,15,-30,-8,0,-30,2,-24,-22,17,-8,1,-6,0,-7,-23,-31,-15,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-2,-24,-2,6,-24,1,-1,-23,10,-19,-8,0,-11,14,9,-3,-10,-20,-16,-10,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-27,-2,8,-27,-17,-6,-25,28,-22,-8,0,-13,15,24,-5,-7,-20,-22,-11,11;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-42,-34,-27,21,-24,-15,-13,-18,-12,-13,-33,-30,-19,-17,-33,-23,-22,106,44,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-26,-6,-8,-28,31,-15,-33,1,-29,-17,1,-16,-8,-2,4,-10,-23,-23,-22,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-25,-24,-31,-23,53,-30,-7,2,-22,7,1,-19,-28,-26,-16,-19,-10,-3,12,41,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-14,-27,-12,-1,-19,-19,-16,-12,-7,-11,-8,-14,26,-6,-9,-6,-1,-13,-26,-18,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-21,9,9,-20,-15,-1,-17,-5,-15,-11,3,-11,3,-8,3,-1,-15,-28,-10,5;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=54.7,333445;
NR   /TOTAL=96(53); /POSITIVE=96(53); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=4;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Fibronectin type-II;
CC   /VERSION=1;
DR   Q9GL25, ESPB1_CANFA, T; Q96BH3, ESPB1_HUMAN, T; Q7YR83, ESPB1_PIG  , T; DR   P98140, FA12_BOVIN , T; Q04962, FA12_CAVPO , T; P00748, FA12_HUMAN , T; DR   O97507, FA12_PIG   , T; P07589, FINC_BOVIN , T; P02751, FINC_HUMAN , T; DR   P11276, FINC_MOUSE , T; Q91400, FINC_NOTVI , T; P04937, FINC_RAT   , T; DR   Q91740, FINC_XENLA , T; Q6QNF4, HGFA_CANFA , T; Q04756, HGFA_HUMAN , T; DR   Q9R098, HGFA_MOUSE , T; O60449, LY75_HUMAN , T; Q920P9, LY75_MESAU , T; DR   Q60767, LY75_MOUSE , T; Q9GLE5, MMP2_BOVIN , T; Q90611, MMP2_CHICK , T; DR   P08253, MMP2_HUMAN , T; P33434, MMP2_MOUSE , T; P50757, MMP2_RABIT , T; DR   P33436, MMP2_RAT   , T; P52176, MMP9_BOVIN , T; O18733, MMP9_CANFA , T; DR   P14780, MMP9_HUMAN , T; P41245, MMP9_MOUSE , T; P41246, MMP9_RABIT , T; DR   P50282, MMP9_RAT   , T; P08169, MPRI_BOVIN , T; P11717, MPRI_HUMAN , T; DR   Q07113, MPRI_MOUSE , T; P22897, MRC1_HUMAN , T; Q61830, MRC1_MOUSE , T; DR   Q9UBG0, MRC2_HUMAN , T; Q64449, MRC2_MOUSE , T; Q4TU93, MRC2_RAT   , T; DR   P80964, PB1_PIG    , T; P49259, PLA2R_BOVIN, T; Q13018, PLA2R_HUMAN, T; DR   Q62028, PLA2R_MOUSE, T; Q5R880, PLA2R_PONPY, T; P49260, PLA2R_RABIT, T; DR   Q9UBV2, SE1L1_HUMAN, T; Q9ESM7, SE1L1_MESAU, T; Q9Z2G6, SE1L1_MOUSE, T; DR   Q80Z70, SE1L1_RAT  , T; P02784, SFP1_BOVIN , T; P04557, SFP3_BOVIN , T; DR   P81019, SFP4_BOVIN , T; P81121, SP1_HORSE  , T; 3D   1CK7; 1CXW; 1E88; 1E8B; 1EAK; 1GXD; 1H8P; 1J7M; 1KS0; 1L6J; 1LKG; 1PDC; 
3D   1QO6; 2CEB; 2CEC; 2FN2; 
PR   PRU00479; 
DO   PDOC00022;
//